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Sequencher DNA 序列分析软件 5.4.6

2024年发布

Sequencher DNA序列分析软件是科学家们必备的工具。持续发展和改进超过25年，Sequencher提供了无与伦比的功能特征，成千上万的出版物都有相关的应用介绍。新手用户可以以最少的时间投资产生结果，而有经验的用户会惊叹于功能的深度和控制。Sequencher自带各种专有算法，可以为Sanger, Next-Gen Sequencing (NGS)和RNA-Seq序列数据生成结果。

Sanger

Sequencher Connections中运行的 Primer-BLAST发送引物序列到您的Sequencher项目中。

在项目窗口中轻松使用一致性序列，作为NGS测序比对混合的参考序列。

新批量处理恢复结束命令。

在项目窗口中调整字体大小的功能。

NGS

GSNAP和BWA-MEM工作流更快。

构建GSNAP数据库和BWA索引，这些索引可以被重新用于与整个基因组的对齐。

查看并保存用FastQC报告的NGS原始数据文件的质量分数和元数据。

使用SAMtools在您的NGS校准中标记变量来生成不同的调用文件(VCF)。

RNA-Seq

随着Cuffquant和Cuffnorm的添加，扩展了Cufflinks套件的功能。

Cuffdiff和 Cuffnorm独一无二的Conditions and Replicates编辑器。

使用自定义排序和筛选选项来增强RNA-Seq可视化功能。

使用增强的外部数据浏览器轻松管理所有的DNA-Seq和RNA-Seq项目。

产品特点

Sequencher使传统的序列装配变得容易，同时又能让您保持对序列的控制。精简数据质量差的序列。您甚至可以创建一个整洁的标准库，让一切变得更简单。通过直观的控制，您可以为数据选择最佳算法，包括汇编到参考中。如果您正在处理来自不同来源的多个示例，可以通过名称来对它们进行自动装配。使用工具编辑数据从来没有如此简单过，帮助您定位和处理模棱两可的问题，还可以检查杂合子并移动您的数据。使用信任值帮助修整数据、质量检查和SNP检测，以提高数据结果的质量。

系统与硬件要求

项目	Windows推荐配置	Mac推荐配置
操作系统	Windows 10、Windows 8.1、Windows 8和Windows 7	Mac平台：10.7、10.8、10.9、10.10、10.11和10.12。
CPU	-	-
内存	3 GB RAM	8 GB RAM
存储	280 MB	355 MB
显卡	-	-
显示器	-	-
其他	•运行DNA测序和RNA测序工具的最低要求是580 MB的可用硬盘空间。 •处理DNA序列和RNA序列数据需要额外的8 GB RAM。对于GSNAP，建议至少16 GB。	使用DNA Seq Tools处理NGS数据需要额外的6 GB RAM。对于GSNAP，建议至少16 GB。