
Sequencher DNA 序列分析软件 De Novo Assembly
Velvet
Velvet是Sequencher v5.1时添加的插件,Velvet是一个知名的从头汇编程序,它不需要参考序列。Velvet包含两个程序。Velveth准备数据集时,Velvetg调用de Bruijn图形方法执行组装步骤。Velvetg构建重叠群,甚至尝试拼接重叠群。Velvet可以使用Multiplex ID数据来执行从头组装。Sequencher自动将数据按条形码分成单独的文件(bins),然后将它们对齐,并将结果放入单独的结果文件夹中。然后可以在Tablet浏览器中查看结果。每个重叠群的一致序列将出现在Project Window中。