在开始调整数据之前,先停下来考虑一下,我们的数据到底如何?现在我们可以用FastQC Quality Reports。我们在Sequencher中添加了FastQC程序。从Sequence > Analyses > FastQ Quality Report…启动此功能,您可以得到多达12种不同的度量结果。从‘Per base sequence quality’ 到‘Kmer Content’,从Sequence Duplication Levels’ 到 ‘Overrepresented sequences’,结果给出一个易于理解的交通灯系统图以及更详细的图表。
在组装前,使用报表监控个人数据集的质量,或随时监控质量。