Sequencher DNA 序列分析软件 自动化分析
Sequencher批量处理您的DNA序列数据的方式是透明的、用户可定义的以及可恢复的,
Sequencher不会为了自动化而影的科学结论的有效性。Sequencher总是给您序列编辑的最终选择。
Sequencher始终保持两个数据副本,编辑的和原始导入的数据。当将恢复到实验数据命令应用到项目中的序列选择或序列中的基础选择时,可以撤消所有或部分编辑内容。按名称组装工具允许您选择片段名称的一部分作为作为共享标识符或“汇编句柄”。Sequencher自动选择和命名重叠群。Sequencher甚至支持正则表达式匹配来设置唯一的ID!
例如,通过点击一个按钮,您可以将90个文件、45对正向和反向序列转换成45个根据患者ID命名的重叠群。序列组装参数的更改会重新组合片段,因此,您可以根据克隆ID、日期、引物或您在序列名称中记录的任何其他特征来组装重叠群。
如果您做了大量的测序或您有大量的样品是用一套标准的测序引物完成的,那么按名称组装是特别有用的。按名称汇编的其他一些应用程序包括:
• MHC和线粒体基因的序列鉴定及群体研究
• 候选基因的PCR产物分析
• 测序保守基因跨物种的系统学
• 跟踪抗病毒药物或疫苗的耐药性监测病毒基因组序列