Discovery Studio 2024,开启你的药物设计之旅!

 

01

新功能

 

药效团

(1)PharmaDB Profiler协议报告每个独特功能的映射详细信息;

(2)PharmaDB Filter协议可以使用pdb_id或scpdb_id进行过滤;

 

客户端

核酸链的主链可以在Discovery Studio客户端中通过残基进行着色;

 

 

02

增强功能

(1)Perl脚本语言升级到5.36.0;

(2)通过残基对核酸主链进行着色;

(3)药效团理论的帮助信息现在包括,提供有关形状评分和药效团特征特性的详细信息;

(4)动力学(Production)、动力学(NAMD)、GaMD平衡和GaMD Production协议进行了更新,包括改进的参数验证,以及对时间步长参数的修改,缩小选择范围到特定范围内的离散增量;

(5)提前安装Pipeline Pilot 2024;

(6)改进了Align Sequence Profiles(Align 123)协议中Use Secondary Structure参数的帮助文本,并在选择DSC或TRANSMEM二级结构进行对齐时,如果没有提供正确的二级结构输入,则增加了错误处理信息;

(7)以下协议不能从Discovery Studio客户端访问:更新抗体数据库、下载BLAST DB文件、更新BLAST数据库、构建PDB引用数据和自定义Discovery Studio模板。只能从Pipeline Pilot Professional客户端访问;

(8)Intel MPI升级到2021.10;

(9)Qt Windows库更新到5.15.14版本,以解决安全漏洞;

(10)PharmaDB Profiler协议报告每个唯一函数的映射详细信息,PharmaDB Filter协议支持使用pdb_id和scpdb_id进行过滤;

 

 

03

修补功能

(1)当平台参数设置为GPU时,Dock Proteins(ZDOCK)协议在Windows上不再失败;

(2)从默认值修改Tolerance参数后,Create 3D Fingerprint协议不再失败;

(3)使用指定为快捷路径的重新启动文件从Pipeline Pilot Professional客户端运行时,Dynamics(生产)和Dynamics(平衡)协议不再失败;

(4)分配力场协议不再为相应力场RTF中具有两个字母元素符号的原子生成不正确的原子排序;

(5)分配力场协议使用力场数据更新结构;

(6)Discovery Studio客户端中的PDB Ligand Bond Orders脚本可以正常工作;

(7)如果叠加算法无法收敛,测量轨迹特征、自由能预测和簇一致性协议会产生错误,修改原子选择或参考构象可以解决此错误;

(8)作业描述参数将从MATCH协议的分配力字段和类型配体中删除。这不会影响协议的功能;

(9)Predict Humanization Mutations协议将查询序列的名称包含在最终消息中;

(10)2023 SP1的新主题和产品发布文档中的一个条目错误地说明了RCSB结构搜索协议使用的最新更新的残基数据库中的残基数量。先前版本部分中的相关条目已修复,以指示正确的数字40322;

(11)删除了在Discovery Studio客户端中导入协议的功能,以解决安全漏洞。您可以使用Pipeline Pilot Professional客户端将协议导入服务器;

(12)Perl脚本示例代码,MarkSideChainFormationViolations,按预期在Linux操作系统上的Discovery Studio客户端上运行;

(13)重新启动模拟后,动力学(Production)协议现在可以正确报告进度;

(14)在MSLD Bias Optimization and Production协议中,当Use BLaDE参数设置为False时,可以将“Number of Cores per Simulation”参数设置为1;

(15)“打开URL”对话框中的Discovery Studio客户端PDB配体默认位点定义不再受RCSB支持,并且已从默认URL位置首选项中删除。但是,如果从早期版本的Discovery Studio导入了首选项,则此选项仍可能出现。您可以在Edit >Preferences>Files Explorer>“URL位置”页面中删除它们;

(16)Discovery Studio客户端显示“增强的采样”工具面板;

(17)Discovery Studio客户端中显示了大分子偶极矩监测器的标签;

 

04

公司简介

北京泰科博思科技有限公司(Beijing Tech-Box S&T Co. Ltd.)成立于2007年,是国内领先的分子模拟及虚拟仿真综合解决方案提供商。

北京泰科博思科技有限公司与国际领先的模拟软件厂商、开发团队深入合作,为高校、科研院所和企业在材料、化工、药物、生命科学、环境、人工智能及数据挖掘、虚拟仿真教学等领域提供专业的整体解决方案。用户根据需要在我们的平台上高效的进行各种模拟实验,指导实际的生产设计。

北京泰科博思科技有限公司拥有一支一流的技术服务团队和资深的专家咨询团队,以客户真正需求出发,服务客户,为客户创造价值。我们秉承“职业、敬业、担当、拼搏、合作”的企业精神,致力于用国际领先的软件产品和专业全面的技术支持服务,成为客户可信赖的合作伙伴。

 

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