如何在指定pH下进行分子对接？
岳帅丽
2024-01-09 13:50:08
回答
2024-01-09 17:45:29
有些PDB蛋白具有实验的pH信息，可在Protein Report中读出，如1EQG，实验pH值为6.70，若想在这个pH下进行对接的话，只需在准备蛋白和小分子进行质子化的时候，将pH定为6.7即可。蛋白准备的默认pH为7.4，而配体准备的默认为6.5-8.5。
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