MOLCAS的重点在于多组态量子化学计算，适用于研究电子结构不能用单组态合理描述的体系，如激发态、化学反应的过渡态、重元素（过渡金属、镧系、锕系等）。MOLCAS能在多组态级别进行相对论处理（标量相对论和自旋-轨道耦合），并提供专门为相对论计算设计的基组。