2023生物仿真分析软件榜单

BIOVIA Materials Studio 材料模拟软件平台是科研模拟软件公司Biovia的核心产品。在近20年的发展历程中，Materials Studio获得了来自全球多个科研机构的技术支持，历经23个版本的更新和升级，现已融合多种时、空间尺度的模拟方法，形成了一个包含16个工具包、22个功能模块，可实现从微观电子结构到宏观性能预测的跨尺度科学研究平台，是目前分子模拟领域中相对精确、稳定、高效的产品，在化工、环境、能源、制药、电子、食品、航空航天和汽车等工业领域和教育科研部门有着非常广泛的应用。

GeneMarker是国际生物信息学相关研究分析领域应用十分广泛的 DNA片断分析软件，旨在为领域科研人员、司法刑侦人员提供一个精确、快速、友好、自动化的数据分析平台。作为DNA片段数据分析领域的一个整体解决方案，GeneMarker集成了STR分析，遗传家系处理、峰图定量分析等十几个功能强大的分析应用模块，从而使操作人员摆脱了繁琐、费时的中间步骤，直接对实验结果进行更深入的分析。并且GeneMarker还是一个开放的分析平台；独立于硬件厂商的软件产品，它不但可以支持多家厂商的数据格式，而且还不断增加对世界上各种最新DNA片断分析方法的支持，为您的研究工作提供更大的自由和持久不断的动力。

Discovery Studio™ (简称DS)是,基于Windows/Linux系统和个人电脑、面向生命科学领域的新一代分子建模和模拟环境。它服务于生命科学领域的实验生物学家、药物化学家、结构生物学家、计算生物学家和计算化学家，应用于蛋白质结构功能研究，以及药物发现。为科学家提供易用的蛋白质模拟、优化和药物设计工具。通过高质量的图形、多年验证的技术以及集成的环境，DS将实验数据的保存、管理与专业水准的建模、模拟工具集成在一起，为研究队伍的合作与信息共享提供平台。

Amira是澳大利亚Visage Imaging公司出品的一个功能强大的，多方面的工具软件，用于对数据进行可视化，操纵控制。Amira不仅能够识别生命科学和生物医学的数据的来源以及类型、方式，这些类型包括：光学和电子显微镜、CT，MR，PET，SPECT，超声波、工程和表面建模工具、蛋白数据库和分子模拟，以及各种物理测量和模拟。其软件中所提供的先进的可视化技术，可以支持灵活创造的三维表面和有限元模型为最优的可视化和模拟。同时三维渲染功能也很强大,无论是用于三维数据研究还是演示都能获得优秀的效果。

SnapGene是一款功能强大的多功能的分子生物学工具,能够非常直观的注释分析DNA图谱,创建和共享丰富的注释文件,帮助我们准确清晰地为分子生物学绘制相关图形。软件可以为用户提供可视化和记录DNA克隆和PCR的最快和最简单的方法，帮助用户记录日常分析生物学程序，并为大家提供更安全的方法。软件凭借着无与伦比的可视性和操控性，即使用户是克隆新手也能快速应对复杂任务，准确地设计和模拟克隆过程，测试复杂方案，预防潜在错误，第一次就可获得正确构造。

Geneious是一款综合、跨平台的生物信息学软件，包括操作、发现、共享和探索生物数据，例如DNA序列或蛋白质，系统进化，三维结构信息，出版文献等。它的功能包括序列比对和系统学分析，毗连群，引物设计和克隆和限制性分析，使用NCBI和EMBL，BLAST，蛋白质结构查看，自动化医学搜索等。它甚至包含了一个API，您可以创建您的个人生物信息插件。通过Geneious软件用户可以对分子数据进行全面的调查和分析，并快速的生成基因型微卫星位点和等位基因列表。同时软件支持梯形拟合和峰值调用功能，用户可以更加直观的对比出各种分子之间的异同。

Sequencher是DNA序列分析的工业标准软件。它可以和所有的自动序列分析仪一同工作，并且因为它的Contig 组装、很短的学习曲线、用户友好的编辑工具，以及突出的技术支持而众所周知。Sequencher自带各种专有算法，可以为Sanger, Next-Gen Sequencing (NGS)和RNA-Seq序列数据生成结果。软件在每个基因专业和制药公司中都应用与于序列分析任务， 被生命科学研究者们使用于许多不同的 DNA 序列分析应用方面，包括基因重组、突变检测、法医的人体辨别，以及分类学等等...其能力包括杂合子和 SNP 的检测和分析，cDNA 到 染色体 DNA 的大型间隙对准，比较排序，对置信评分的支持、ORF 转换、基因银行特性化导入、以及限制酶映射等等。

Beacon Designer是一款专业的定量PCR引物和探针设计辅助工具。软件可以帮助用户设计生物实验分析方案，可以让用户在制作一些生物模型的时候获得更好的数据分析平台，本软件可以结合一些化学的公式使用，让用户在分析生物数据的时候加载一些化学的公式到软件上标注，也可以将分析的生物数据转换为基因模型的方式查看;对于pcr引物设计方面的运用还是非常良好的，体用了多种生物反应以及DNA引物的分析技术，让软件帮助完成后期实验数据的分析以及报告制作。