MS脚本兵器营之长虹剑——计算多项体系内两两物质的相互作用能与结合能-BIOVIA Materials Studio-材料仿真分析-软服之家

Materials Studio是一个常用于材料科学领域的模拟软件，其中脚本的作用非常关键。在Materials Studio中，脚本可以自动执行一系列操作来快速完成一些繁琐、耗时的任务，如构建模型、优化结构、分析性质等，并且还提供了强大的编程接口，使用户能够自定义实现各种复杂的计算和分析。

如同古代兵器营一样，Materials Studio脚本在提供了武器和装备的同时，还需有专业的军事工匠进行维护和修理。这就是说，想要用好脚本，就要有一定的技术实力，才能打造成出更加强大的模拟工具，取得对科学研究的更多突破。

如果Materials Studio脚本是兵器营，那么本次给大家分享的脚本就像是兵器营中的长虹剑。在古代，长虹剑是最为重要和精湛的华夏武器，其利刃可断金刚、斩钢如铁。本次的脚本也同样不可小觑，它可对多项体系内轨迹文件进行自动化高精度的相互作用能和结合能计算，以期揭示这些物质内在的物理规律。

脚本：ThreeEint

该脚本是通过实现对”set“对象之间相互作用能的准确计算，并将整个体系内的物质分批进行能量计算，以确保计算结果的准确性和效率。依据公式如下：

脚本往期回顾

东方科软MS技术工程师专门整理并自编了一批脚本，帮助大家提升效率。

脚本中包含了Materials Studio自带的官方脚本，也有东方科软MS技术工程师制作的脚本，一共28个，后续将不断添加完善，敬请关注。

Materials Studio 官方脚本

23个官方脚本主要包括：

为珠子轨迹生成粗粒度交互（玻尔兹曼转换）
使用脚本精确构建模型
对特定分子施加位移并计算能量
自动替换原子并键合
键长/键角列表输出
力场格式转换
监测体系中距离与角度的变化
演示依次处理项目中的每个结构
统计体系氢键键长与数目
演示访问原子及其键合信息
移动特定分子通过沸石中的孔隙
势能面 (PES) 扫描
晶型预测
施加应力得应变（应力应变曲线）
元素替换（枚举合金）结构
粗粒化轨迹文件
指定温度设置速度（可用于导热率）
熔化温度计算

东方科软DIY脚本(持续更新ing…)

自制脚本示例1：自动计算轨迹文件相互作用能

自制脚本示例2：截断能、K点测试脚本

在计算材料电子结构时，需要对计算所需的截断能进行测试，以保证计算结果的准确性，但是步骤重复性太高，时间成本太高。该方法通过自动化截断能测试，实现了计算过程的全自动化，同时保证了计算结果的准确性和可靠性。此外，该方法还具有灵活性和简便性，可以根据不同的计算需求进行灵活的调整和修改，为材料电子结构计算提供了高效、准确的解决方案。

原理：该脚本方法通过在能量差值小于特定值时自动停止，将截断能用于K点测试，实现了全自动化的计算过程。

Materials Studio软件介绍

BIOVIA Materials Studio是一个多尺度、多功能的材料模拟计算平台。在近20多年的发展历程中，Materials Studio获得了来自全球多个科研机构的技术支持，历经28个版本的更新和升级，现已融合多种时间、空间尺度的模拟方法，形成了一个包含16个工具包、25个功能模块，可实现从微观电子结构解析到宏观性能预测的跨尺度科学研究平台。

目前，Materials Studio 软件是分子模拟领域中相对精确、稳定、高效的产品，广泛应用在化学化工、环境、制药、能源、电子、食品、航空航天和汽车等工业领域和教育科研部门有着非常广泛的应用。